علم شیمی

محاسبات انرژی رایگان

Free energy calculations

دانلود کتاب Free energy calculations (به فارسی: محاسبات انرژی رایگان) نوشته شده توسط «Christophe Chipot (editor) – Andrew Pohorille (editor)»


اطلاعات کتاب محاسبات انرژی رایگان

موضوع اصلی: علم شیمی

نوع: کتاب الکترونیکی

ناشر: Springer

نویسنده: Christophe Chipot (editor) – Andrew Pohorille (editor)

زبان: English

فرمت کتاب: pdf (قابل تبدیل به سایر فرمت ها)

سال انتشار: 2007

تعداد صفحه: 528

حجم کتاب: 8 مگابایت

کد کتاب: 3540384472 , 978-3-540-73617-2 , 978-3-540-38447-2 , 978-3-540-38448-9

نوبت چاپ: 1

توضیحات کتاب محاسبات انرژی رایگان

محاسبات انرژی آزاد چندین دهه است که وجود داشته است و اکنون با ادبیات عظیم و جنگل انبوهی از الگوریتم‌ها و پیاده‌سازی‌ها، حوزه‌ای برای خود است. محققان باتجربه باید زمان زیادی را برای به‌روز ماندن سرمایه‌گذاری کنند (همه این کار را نمی‌کنند)، و برای تازه‌واردها می‌تواند بسیار گیج‌کننده باشد. محققان جوان هنوز از مطالب مقدماتی از کتاب های معروف آلن و تیلدزلی و فرنکل و اسمیت استفاده می کنند. اگرچه این تکنیک‌ها بسیار ارزشمند هستند، اما اکنون قدیمی هستند (مخصوصاً آلن و تیلدزلی) و بسیاری از موضوعات دیگر را پوشش می‌دهند، بنابراین جزئیات کمی در مورد تکنیک‌های کلاسیک ارائه می‌کنند و تقریباً هیچ چیز در مورد تکنیک‌های جدیدتر، مانند روش‌های غیرتعادلی یا نمونه‌گیری وانگ-لاندو، ارائه می‌کنند. این کتاب گرد هم می‌آورد. تعداد انگشت شماری از کارشناسان شناخته شده از سراسر جهان، که سعی می کنند وضعیت هنر را در محاسبات انرژی آزاد به روشی مختصر و در عین حال عمیق خلاصه کنند. تازه واردان به این رشته از فصل اول که یک نمای کلی و مقدمه ای بر مفاهیم اساسی می دهد، قدردانی خواهند کرد. فصل‌های بعدی خانواده‌های اصلی روش‌ها را به شیوه‌ای نظام‌مند، از نمونه‌برداری مسیر انتقال تا روش‌های ساده‌شده طراحی‌شده برای درمان کارآمد سیستم‌های بیولوژیکی بزرگ، ارائه می‌کنند. بسته به سبک هر نویسنده، فصل ها دارای تعادل های متفاوتی از نظریه خام و کاربردهای دنیای واقعی هستند. حتی نویسندگانی که عمدتاً در مورد نظریه می نویسند سعی می کنند به مفاهیم عملی توجه داشته باشند. فراتر از معادلات دقیق رسمی، بسیاری از فصل‌ها بر خطاهای نمونه‌گیری محدود و روش‌هایی برای به حداقل رساندن آن‌ها تاکید دارند: در زندگی واقعی، این اغلب تفاوت بین محاسبات انرژی آزاد که کار می‌کنند و محاسباتی که انجام نمی‌دهند، ایجاد می‌کند.


Free energy calculations have been around for several decades, and are now a field of their own, with its massive literature and a thick jungle of algorithms and implementations. Experienced researchers have to invest a lot of time to keep up to date (not everyone does), and to newcomers, it can be very confusing. Young researchers still use introductory material from the famous books of Allen and Tildesley, and Frenkel and Smit. While very precious, those are now old (especially Allen and Tildesley) and cover many other subjects, so they give little detail about classic techniques and virtually nothing about more recent ones, such as nonequilibrium methods or Wang-Landau sampling.This book brings together a handful of recognized experts from around the globe, who try to sum up the state of the art in free energy calculations in a concise, yet in-depth manner. Newcomers to the field will appreciate the first chapter, which gives an overview and an introduction to essential concepts. The following chapters present the main families of methods in a systematic way, from transition path sampling to simplified methods designed to treat large biological systems efficiently. Depending on each author’s style, the chapters have different balances of raw theory and real-world applications. Even authors writing mostly about theory try to keep an eye on practical implications. Beyond the formally exact equations, many chapters put an emphasis on finite sampling errors and methods to minimize them: in real life, that often makes the difference between free energy calculations that work and those that don’t.

دانلود کتاب «محاسبات انرژی رایگان»

مبلغی که بابت خرید کتاب می‌پردازیم به مراتب پایین‌تر از هزینه‌هایی است که در آینده بابت نخواندن آن خواهیم پرداخت.