Эволюционная патология. К вопросу о месте ВИЧ-инфекции и ВИЧ-СПИД-пандемии среди других инфекционных, эпидемических и пандемических процессов

ВВЕДЕНИЕ СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ ГЛАВА 1. ПАРАЗИТЫ И СИМБИОНТЫ ГЕНОМА ЧЕЛОВЕКА 1.1. Проретроэлементы и проретровирусы Проретроэлементы Интроны и экзоны Проретровирусы Ретровирусная эволюция 1.2. Ретроэлементы генома современного вида Homo sapiens Классификация транспозируемых элементов He-LTR-ретроэлементы LTR-ретроэлементы Эволюционная роль HERV-K Эволюционная роль Ll-ретроэлементов Эволюционная роль Alu-элемен-тов Эволюционная роль ретро псевдогенов Прекращение инвазии транспозируемых элементов 1.3. Ретровирусное окружение вида Homo sapiens Структура и цикл жизни ретровирусов Онкогенные ретровирусы Лентивирусы «Пенящиеся ленти-вирусы» Инфицированность лентивирусами диких животных Непатогенная инфекция Реинтеграция и реинфекция ретровирусов Коинфекция ГЛАВА 2. ВНУТРИКЛЕТОЧНЫЕ ПАРАЗИТЫ И СИМБИОНТЫ МНОГОКЛЕТОЧНЫХ ОРГАНИЗМОВ 2.1. Первичный резервуар патогенных для человека микроорганизмов Предыстория проблемы Простейшие и их паразиты Границы феномена сапронозного существования патогенных для людей микроорганизмов Предадаптация к макрофагам Исторические свидетельства 2.2. Простейшие — симбионты многоклеточных «Чужие здесь не ходят» Возбудитель сибирской язвы Возбудители бруцеллеза Возбудитель туляремии Возбудитель чумы Вирус натуральной оспы Микобактерии Ретровирусы 2.3. Архейские предки иммунной системы человека Локус генов Ragl/2 Суперсемейство иммуноглобулинов Реликтовая иммунная система человека «Сборка» многоклеточных организмов Третий акт творения — «кембрийский взрыв» Торможение эволюции Гуморальная и клеточная иммунные системы Белки AID/APOBEC TRlM5a ГЛАВА 3. ИНФЕКЦИОННЫЕ ПРОЦЕССЫ 3.1. Циклические инфекционные монопроцессы Генерализация поксвирусной инфекции Антигенная детерминанта поксвирусов Иммунные ответы на поксвирусы Трансмиссионный потенциал BHO Продолжительность противооспенного иммунитета 3.2. Нециклические инфекционные процессы Генерализация ВИЧ Трансмиссионный потенциал ВИЧ Нарушения иммунной системы при ВИЧ-инфекции Антигенные детерминанты ВИЧ Антитела с широким нейтрализующим действием Антигенные свойства УЗ-домена gpl20 Первичный антигенный грех Комплемент Феномен антителозависимого усиления инфекции Инфекционно-эволюционные качели Эволюционный смысл ВИЧ-инфекции 3.3. Многокомпонентные нециклические инфекционные процессы Надклеточный уровень Клеточный уровень Уровень генома ГЛАВА 4. ПАНДЕМИЧЕСКИЕ И ЭПИДЕМИЧЕСКИЕ ПРОЦЕССЫ 4.1. Пандемические и эпидемические процессы, вызываемые паразитами, использующими стратегию первого типа 4.1.1. Терминология К определению терминов «природный очаг» и «природный резервуар» возбудителей инфекционных болезней Типы первичных природных резервуаров Первичный природный очаг возбудителя инфекционной болезни Вторичный природный очаг возбудителя инфекционной болезни Общие свойства вторичных природных резервуаров возбудителей опасных инфекционных болезней 4,1.2. Циклические пандемические и эпидемические монопроцессы Пандемии чумы Пандемии холеры Пандемии гриппа Стадии эпидемических монопроцессов циклического типа Незавершающиеся циклические эпидемические монопроцессы 4.2. Пандемические и эпидемические процессы, вызываемые паразитами, использующими стратегию второго типа 4.2.1. Терминология Трудности терминологии для пандемических и эпидемических процессов нециклического типа Терминология привычного для человека масштаба времени 4.2.2. Нециклические пандемические и эпидемические процессы Типовые периоды нециклического эпидемического пандемического процесса Почему невозможно использовать вакцинацию в борьбе с ВИЧ/СПИД-пандемией 4.2.3. Глобальные пандемические циклы Морфологическая структура эпидемических очагов нециклического типа «Молчащие педиатрические инфекции» ССК5-рецептор «Змеиный клубок» Эволюционные процессы в ВИЧ-инфицированных популяциях людей Возвращение оспы Глобальный многовековой цикл циклических и нециклических инфекций 4.3. «Болезни эндогенной ретровирусной активности» Инфицирование ретроэлементами генома таксона Эпидемиология не-ЬТЯ-ретроэлементов Эпидемиология LTR-ретроэлементов Суперантигенные свойства HERV и многокомпонентные нециклические инфекционные процессы ЗАКЛЮЧЕНИЕ СЛОВАРЬ ТЕРМИНОВ СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ