“十二五”普通高等教育本科规划教材 生物化学原理 第3版

1 (p1): 第一篇 结构生物化学 2 (p1-1): 结构生物化学内容简介和学习方法 4 (p1-2): 第一章 氨基酸 4 (p1-2-1): 第一节 氨基酸的结构、种类和分类 4 (p1-2-1-1): 一、蛋白质氨基酸 7 (p1-2-1-2): 二、非蛋白质氨基酸 8 (p1-2-2): 第二节 氨基酸的性质和功能 8 (p1-2-2-1): 一、氨基酸的性质 9 (p1-2-2-2): 框1-1生物医药——药物的手性 12 (p1-2-2-3): 二、氨基酸的功能 13 (p1-2-3): 第三节 氨基酸的分离与纯化 13 (p1-2-3-1): 一、电泳 13 (p1-2-3-2): 二、层析 14 (p1-2-3-3): 科学故事——第22种蛋白质氨基酸的发现 16 (p1-3): 第二章 蛋白质的结构 16 (p1-3-1): 第一节 肽 16 (p1-3-1-1): 一、肽的分类和命名 17 (p1-3-1-2): 框2-1生化点滴——五花八门的蛋白质命名方法 18 (p1-3-1-3): 二、寡肽的理化性质 18 (p1-3-1-4): 三、几种天然存在的活性肽 18 (p1-3-2): 第二节 蛋白质的结构 18 (p1-3-2-1): 一、蛋白质的一级结构 21 (p1-3-2-2): 二、蛋白质的二级结构 26 (p1-3-2-3): 框2-2生化大师的传奇——感冒期间的感悟 29 (p1-3-2-4): 三、蛋白质的三级结构 37 (p1-3-2-5): 四、蛋白质的四级结构 39 (p1-3-3): 第三节 蛋白质的折叠历程与结构预测 39 (p1-3-3-1): 一、蛋白质折叠的基本规律 43 (p1-3-3-2): 二、蛋白质折叠的历程 44 (p1-3-3-3): 框2-3大蛋白“能屈能伸”的故事 46 (p1-3-3-4): 三、与蛋白质错误折叠相关的疾病 48 (p1-3-3-5): 四、蛋白质结构预测 50 (p1-3-4): 第四节 蛋白质组及蛋白质组学 51 (p1-3-4-1): 科学故事——“一级结构决定三维结构”学说的提出 53 (p1-4): 第三章 蛋白质的功能及其与结构之间的关系 53 (p1-4-1): 第一节 蛋白质的功能 54 (p1-4-2): 第二节 蛋白质结构与功能之间的关系 56 (p1-4-3): 第三节 几种重要的蛋白质的结构与功能 56 (p1-4-3-1): 一、纤维状蛋白质的结构与功能 59 (p1-4-3-2): 框3-1生化应用——蜘蛛丝/蚕丝复合纤维的制备及其应用价值 60 (p1-4-3-3): 框3-2生化新发现——溴也成为生命元素啦 61 (p1-4-3-4): 二、球状蛋白质的结构与功能 68 (p1-4-3-5): 框3-3生化医药——丁酸的妙用 69 (p1-4-3-6): 三、膜蛋白的结构与功能 71 (p1-4-3-7): 四、天然无折叠蛋白质的结构与功能 72 (p1-4-3-8): 框3-4生化新发现——天然无折叠蛋白的新功能 73 (p1-4-4): 第四节 蛋白质功能预测 74 (p1-4-4-1): 科学故事——一种多功能蛋白质的发现 76 (p1-5): 第四章 蛋白质的理化性质、分类及研究方法 76 (p1-5-1): 第一节 蛋白质的理化性质 80 (p1-5-1-1): 框4-1生化探究——嗜热蛋白和嗜冷蛋白耐热和抗冷的秘密 81 (p1-5-2): 第二节 蛋白质的分类 82 (p1-5-2-1): 框4-2身边的生物化学——毒也美丽 82 (p1-5-3): 第三节 蛋白质的研究方法 82 (p1-5-3-1): 一、蛋白质的分离和纯化 89 (p1-5-3-2): 二、蛋白质大小的确定 89 (p1-5-3-3): 三、蛋白质等电点的测定 90 (p1-5-3-4): 四、蛋白质在机体内表达的分析 90 (p1-5-3-5): 五、蛋白质一级结构的测定 96 (p1-5-3-6): 六、蛋白质三维结构的确定 96 (p1-5-3-7): 七、蛋白质功能的研究 96 (p1-5-3-8): 八、多肽的固相合成 96 (p1-5-3-9): 科学故事——NGF的发现 99 (p1-6): 第五章 核苷酸 99 (p1-6-1): 第一节 核苷酸的结构与组成 99 (p1-6-1-1): 一、碱基 100 (p1-6-1-2): 框5-1生化新视野——DNA的第6个碱基 101 (p1-6-1-3): 二、核苷 103 (p1-6-1-4): 三、核苷酸 106 (p1-6-2): 第二节 核苷酸的功能 106 (p1-6-2-1): 科学故事——“生命字母表”的人工扩增 108 (p1-7): 第六章 核酸的结构与功能 108 (p1-7-1): 第一节 核酸的分类 109 (p1-7-1-1): 框6-1生化聚焦——DNA分子一定没有“你”(U)吗? 111 (p1-7-2): 第二节 核酸的一级结构 112 (p1-7-3): 第三节 核酸的二级结构 112 (p1-7-3-1): 一、DNA的二级结构 114 (p1-7-3-2): 框6-2生化探究——“大沟”和“小沟”中的秘密 122 (p1-7-3-3): 二、RNA的二级结构 124 (p1-7-3-4): 框6-3生化探究——为何是DNA而不是RNA作为遗传信息的载体? 125 (p1-7-4): 第四节 核酸的三级结构 126 (p1-7-4-1): 一、DNA的三级结构 126 (p1-7-4-2): 二、RNA的三级结构 130 (p1-7-5): 第五节 核酸与蛋白质形成的复合物 130 (p1-7-5-1): 一、DNA与蛋白质形成的复合物 132 (p1-7-5-2): 二、RNA与蛋白质形成的复合物 133 (p1-7-6): 第六节 核酸的功能 133 (p1-7-6-1): 科学故事——DNA双螺旋结构的发现 135 (p1-8): 第七章 核酸的理化性质及研究方法 135 (p1-8-1): 第一节 核酸的理化性质 138 (p1-8-1-1): 框7-1 生化探究——嗜热生物是如何保护自己的基因组DNA的? 140 (p1-8-1-2): 框7-2生化动态——肽核酸的发现及其应用 140 (p1-8-2): 第二节 核酸研究的技术和方法 140 (p1-8-2-1): 一、核酸的化学合成 141 (p1-8-2-2): 二、核酸的分离、纯化和定量 142 (p1-8-2-3): 三、核酸一级结构的测定 148 (p1-8-2-4): 框7-3生化趣事——年度分子和年度突破 149 (p1-8-2-5): 科学故事——基因组数据库的建立 150 (p1-9): 第八章 酶学概论 150 (p1-9-1): 第一节 酶的化学本质 151 (p1-9-2): 第二节 酶的催化性质 153 (p1-9-2-1): 框8-1 生化趣事——催化动力、生化武器与投弹手甲虫 156 (p1-9-3): 第三节 酶的分类和命名 156 (p1-9-3-1): 一、酶的分类 156 (p1-9-3-2): 二、酶的命名 157 (p1-9-3-3): 科学故事——酶化学本质的确定 158 (p1-10): 第九章 酶动力学 158 (p1-10-1): 第一节 影响酶促反应的因素 158 (p1-10-1-1): 一、影响反应速率的外因 160 (p1-10-1-2): 二、影响反应速率的内因 161 (p1-10-2): 第二节 米氏动力学 161 (p1-10-2-1): 一、米氏方程成立的条件 161 (p1-10-2-2): 二、米氏方程的推导 162 (p1-10-2-3): 三、米氏方程的解读和延伸 164 (p1-10-2-4): 框9-1理论联系实际——甲醇或二甘醇中毒的解毒 165 (p1-10-2-5): 四、米氏方程的双重性 165 (p1-10-2-6): 五、米氏方程的线性转换 166 (p1-10-3): 第三节 米氏酶抑制剂作用的动力学 167 (p1-10-3-1): 一、可逆性抑制剂 170 (p1-10-3-2): 二、不可逆性抑制剂 172 (p1-10-4): 第四节 多底物反应动力学 172 (p1-10-4-1): 一、多底物反应中的一些专门术语 173 (p1-10-4-2): 二、多底物反应的动力学机制 173 (p1-10-5): 第五节 别构酶的动力学 173 (p1-10-5-1): 一、别构酶的性质 175 (p1-10-5-2): 二、别构机制 175 (p1-10-5-3): 三、S形曲线和Hill方程 176 (p1-10-5-4): 四、Hill作图 176 (p1-10-5-5): 五、协同性的优点 178 (p1-11): 第十章 酶的催化机制 178 (p1-11-1): 第一节 酶催化机制研究的主要方法 179 (p1-11-2): 第二节 过渡态稳定学说 179 (p1-11-2-1): 一、过渡态稳定学说的提出 181 (p1-11-2-2): 二、支持过渡态稳定学说的证据 182 (p1-11-2-3): 框10-1 生化制药——水解可卡因药物的研制 183 (p1-11-3): 第三节 过渡态稳定的化学机制 183 (p1-11-3-1): 一、邻近定向效应 184 (p1-11-3-2): 二、广义的酸碱催化 184 (p1-11-3-3): 三、静电催化 186 (p1-11-3-4): 四、金属催化 186 (p1-11-3-5): 五、共价催化 188 (p1-11-3-6): 六、底物形变 188 (p1-11-4): 第四节 几种常见酶的结构与功能 189 (p1-11-4-1): 一、蛋白酶 192 (p1-11-4-2): 二、溶菌酶 196 (p1-12): 第十一章 核酶 196 (p1-12-1): 第一节 核酶的种类 196 (p1-12-1-1): 框11-1生化热点——DNA也能催化吗? 196 (p1-12-2): 第二节 核酶的催化机制 196 (p1-12-2-1): 一、小核酶的催化机制 196 (p1-12-2-2): 二、大核酶的催化机制 196 (p1-12-3): 第三节 核酶发现的意义及其应用 196 (p1-12-3-1): 框11-2生化新见解——“病毒创造了DNA”? 196 (p1-12-3-2): 科学故事——核酶的发现 196 (p1-13): 第十二章 酶活性的调节 196 (p1-13-1): 第一节 酶的“量变” 196 (p1-13-1-1): 一、同工酶 197 (p1-13-1-2): 二、酶的合成和降解 198 (p1-13-2): 第二节 酶的“质变” 198 (p1-13-2-1): 一、别构调节 202 (p1-13-2-2): 二、共价修饰调节 203 (p1-13-2-3): 三、水解激活 205 (p1-13-2-4): 四、受调节蛋白的调节 206 (p1-13-2-5): 框12-1生化趣事——“分子捕鼠器”的威力 207 (p1-13-2-6): 五、构成酶的亚基之间的聚合与解离 208 (p1-13-2-7): 科学故事——假酶的新生 209 (p1-14): 第十三章 酶的应用及研究方法 210 (p1-14-1): 第一节 酶活力的测定 210 (p1-14-1-1): 一、酶活力的表示方法 210 (p1-14-1-2): 二、酶活力测定的方法 210 (p1-14-2): 第二节 酶的分离和纯化 210 (p1-14-3): 第三节 酶工程 210 (p1-14-3-1): 一、固定化酶 210 (p1-14-3-2): 二、人工酶 210 (p1-14-3-3): 三、定点突变酶 210 (p1-14-3-4): 四、杂交酶 210 (p1-14-3-5): 五、抗体酶 210 (p1-14-3-6): 框13-1生化动态——抗体酶的新来源 210 (p1-14-3-7): 科学故事——第一例从头设计的人工酶的诞生 210 (p1-15): 第十四章 维生素与辅酶 210 (p1-15-1): 第一节 水溶性维生素 210 (p1-15-1-1): 一、B族维生素 215 (p1-15-1-2): 框14-1生化应用——生物素-亲和素检测系统的建立和应用 217 (p1-15-1-3): 二、维生素C 217 (p1-15-1-4): 框14-2生化聚焦——我们人类为什么自己合成不了维生素C? 218 (p1-15-2): 第二节 脂溶性维生素 218 (p1-15-2-1): 一、维生素A 219 (p1-15-2-2): 二、维生素D 220 (p1-15-2-3): 三、维生素E 220 (p1-15-2-4): 四、维生素K 221 (p1-15-2-5): 科学故事——维生素的发现 223 (p1-16): 第十五章 糖类 223 (p1-16-1): 第一节 单糖 223 (p1-16-1-1): 一、单糖的命名和缩写 223 (p1-16-1-2): 二、单糖的结构 223 (p1-16-1-3): 框15-1生化热点——生命的手性选择之谜 225 (p1-16-1-4): 三、单糖的性质 228 (p1-16-1-5): 四、几种生化上重要的单糖 228 (p1-16-1-6): 五、单糖的衍生物 229 (p1-16-2): 第二节 寡糖 229 (p1-16-2-1): 一、还原性二糖 229 (p1-16-2-2): 二、非还原性二糖 230 (p1-16-3): 第三节 多糖 231 (p1-16-3-1): 一、贮能多糖 232 (p1-16-3-2): 二、结构多糖 233 (p1-16-3-3): 框15-2生化与健康——蛀牙与防蛀牙 235 (p1-16-4): 第四节 糖缀合物 235 (p1-16-4-1): 一、糖蛋白和蛋白聚糖 236 (p1-16-4-2): 二、肽聚糖 237 (p1-16-4-3): 三、糖脂与脂多糖 239 (p1-17): 第十六章 脂质与生物膜 239 (p1-17-1): 第一节 脂质的化学结构及其功能 239 (p1-17-1-1): 一、简单脂 240 (p1-17-1-2): 框16-1生化与健康——因纽特人健康的秘密 241 (p1-17-1-3): 二、复合脂 243 (p1-17-1-4): 三、异戊二烯类脂 245 (p1-17-2): 第二节 生物膜的结构及其功能 245 (p1-17-2-1): 一、生物膜的化学组成 247 (p1-17-2-2): 二、生物膜的基本结构与性质 248 (p1-17-2-3): 框16-2生化动态——脂质体的应用 251 (p1-17-3): 第三节 物质的跨膜转运 251 (p1-17-3-1): 一、离子和小分子物质的跨膜运输 254 (p1-17-3-2): 二、大分子物质的跨膜运输 254 (p1-17-3-3): 科学故事——水孔蛋白的发现 256 (p1-18): 第十七章 激素及其受体介导的信号转导 256 (p1-18-1): 第一节 激素的一般性质 256 (p1-18-1-1): 一、激素的定义 257 (p1-18-1-2): 二、激素的化学本质、分类和生物合成 258 (p1-18-1-3): 三、激素的定量 259 (p1-18-2): 第二节 激素作用的一般特征 259 (p1-18-2-1): 一、特异性 259 (p1-18-2-2): 框17-1生化与健康——瘦肉精、喘息定与萘心安 262 (p1-18-2-3): 二、高效性 262 (p1-18-2-4): 三、可能需要“第二信使” 263 (p1-18-2-5): 四、可能产生“快反应”或“慢反应” 263 (p1-18-2-6): 五、脱敏性 263 (p1-18-2-7): 六、时效性 263 (p1-18-3): 第三节 激素作用的详细机制 263 (p1-18-3-1): 一、脂溶性激素的作用机制 264 (p1-18-3-2): 二、水溶性激素的作用机制 270 (p1-18-3-3): 框17-2生化大突破一PKC竟是肿瘤抑制因子 276 (p1-18-3-4): 框17-3生化趣事——毒气是毒是福? 277 (p1-18-3-5): 三、信号的终止 279 (p1-18-3-6): 四、信号转导的整合 279 (p1-18-4): 第四节 激素的分泌及其调节 281 (p1-18-4-1): 科学故事——蛋白质“可逆磷酸化”的发现 283 (p2): 第二篇 代谢生物化学 284 (p2-1): 代谢生物化学内容简介及学习方法 286 (p2-2): 第十八章 代谢总论 286 (p2-2-1): 第一节 代谢的基本概念 288 (p2-2-1-1): 框18-1生化聚焦——底物通道运输 289 (p2-2-2): 第二节 代谢的基本特征 290 (p2-2-3): 第三节 代谢研究的主要内容和方法 291 (p2-2-3-1): 框18-2生化突破——让“酵母君”酿造鸦片,你相信吗? 292 (p2-2-4): 第四节 代谢中的氧化还原反应和氧气在代谢中的作用 292 (p2-2-5): 第五节 代谢组和代谢组学 294 (p2-3): 第十九章 生物能学 294 (p2-3-1): 第一节 热力学定律与Gibbs-Helmholtz方程 294 (p2-3-2): 第二节 生化反应的方向性与自由能之间的关系 295 (p2-3-3): 第三节 △G与△E之间的关系 296 (p2-3-4): 第四节 生命系统内的偶联反应 297 (p2-3-5): 第五节 高能生物分子 299 (p2-4): 第二十章 生物氧化 299 (p2-4-1): 第一节 呼吸链 299 (p2-4-1-1): 一、呼吸链的组分 302 (p2-4-1-2): 二、呼吸链组分的排列顺序 303 (p2-4-1-3): 三、复合体I、II、III和IV的结构与功能 306 (p2-4-1-4): 四、呼吸体 307 (p2-4-1-5): 框20-1生化动态——厌氧生物的呼吸链 308 (p2-4-2): 第二节 氧化磷酸化 308 (p2-4-2-1): 一、氧化磷酸化的偶联机制 311 (p2-4-2-2): 框20-2生化研究动态——复合体I的结构:细胞中的蒸汽机 312 (p2-4-2-3): 二、F1F0-ATP合酶的结构与功能 312 (p2-4-2-4): 三、F1F0-ATP合酶的催化机制 316 (p2-4-2-5): 四、氧化磷酸化的抑制 318 (p2-4-2-6): 框20-3 生化趣事——炸药与减肥 318 (p2-4-2-7): 五、P/O值与氧化磷酸化的调节 319 (p2-4-2-8): 科学故事——“结合变构”学说的发现 322 (p2-5): 第二十一章 生物大分子的消化和吸收 322 (p2-5-1): 第一节 糖类的消化和吸收 322 (p2-5-1-1): 一、双糖、寡糖和多糖的酶促降解 322 (p2-5-1-2): 二、单糖的吸收和转运 322 (p2-5-1-3): 框21-1生化与健康——乳糖不耐受症 322 (p2-5-2): 第二节 脂质的消化和吸收 322 (p2-5-2-1): 一、脂质的酶促降解 322 (p2-5-2-2): 二、脂质的吸收 322 (p2-5-3): 第三节 蛋白质与核酸的消化和吸收 322 (p2-5-3-1): 一、蛋白质的酶促降解 322 (p2-5-3-2): 二、氨基酸、二肽和三肽的吸收 322 (p2-5-3-3): 三、核酸的消化和吸收 322 (p2-5-3-4): 框21-2身边的生物化学——猪笼草吃荤的秘密 322 (p2-5-3-5): 科学故事——葡萄糖转运蛋白的发现 322 (p2-6): 第二十二章 糖酵解 322 (p2-6-1): 第一节 糖酵解的发现 324 (p2-6-2): 第二节 糖酵解的全部反应 332 (p2-6-3): 第三节 NADH和丙酮酸的命运 332 (p2-6-3-1): 一、在有氧状态下NADH和丙酮酸的命运 335 (p2-6-3-2): 二、在缺氧或无氧状态下NADH和丙酮酸的命运 336 (p2-6-3-3): 框22-1 生化趣事——不喝酒也醉酒的秘密 336 (p2-6-4): 第四节 其他物质进入糖酵解 336 (p2-6-4-1): 一、糖原 336 (p2-6-4-2): 二、果糖 337 (p2-6-4-3): 三、甘露糖 337 (p2-6-4-4): 四、甘油 337 (p2-6-4-5): 五、半乳糖 338 (p2-6-5): 第五节 糖酵解的生理功能 339 (p2-6-5-1): 框22-2生化探究——古菌细胞内糖酵解的变化 340 (p2-6-6): 第六节 糖酵解的调节 340 (p2-6-6-1): 一、葡萄糖的可得性 341 (p2-6-6-2): 二、己糖激酶和葡糖激酶的调节 341 (p2-6-6-3): 三、PFK-1的调节 344 (p2-6-6-4): 四、丙酮酸激酶的调节 345 (p2-6-6-5): 框22-3理论联系实际——教你制作葡萄酒 346 (p2-7): 第二十三章 三羧酸循环 346 (p2-7-1): 第一节 三羧酸循环的发现 347 (p2-7-2): 第二节 三羧酸循环的全部反应 347 (p2-7-2-1): 一、反应历程 350 (p2-7-2-2): 框23-1生化聚焦——代谢异常与细胞癌变之间的关系 352 (p2-7-2-3): 二、三羧酸循环小结 353 (p2-7-3): 第三节 三羧酸循环的生理功能 354 (p2-7-4): 第四节 乙醛酸循环 356 (p2-7-5): 第五节 三羧酸循环的回补反应 356 (p2-7-6): 第六节 三羧酸循环的调控 357 (p2-7-6-1): 一、柠檬酸合酶的调控 357 (p2-7-6-2): 二、异柠檬酸脱氢酶的调控 358 (p2-7-6-3): 三、α-酮戊二酸脱氢酶系的调控 358 (p2-7-6-4): 四、丙酮酸脱氢酶系的调控 358 (p2-7-7): 第七节 TCA循环的起源和进化 359 (p2-7-7-1): 框23-2理论联系实际——短跑、中跑与长跑的能量消耗 361 (p2-8): 第二十四章 磷酸戊糖途径 361 (p2-8-1): 第一节 磷酸戊糖途径的全部反应 361 (p2-8-1-1): 一、氧化相 362 (p2-8-1-2): 二、非氧化相 364 (p2-8-1-3): 三、磷酸戊糖途径小结 365 (p2-8-2): 第二节 磷酸戊糖途径的功能 365 (p2-8-2-1): 一、与NADPH有关的功能 366 (p2-8-2-2): 框24-1生化与健康——蚕豆与溶血性贫血 366 (p2-8-2-3): 二、与5-磷酸核糖有关的功能 366 (p2-8-2-4): 三、与4-磷酸赤藓糖有关的功能 366 (p2-8-2-5): 科学故事——恩特纳和杜多罗夫途径的发现 369 (p2-9): 第二十五章 糖异生 369 (p2-9-1): 第一节 糖异生所涉及的全部反应 369 (p2-9-1-1): 一、糖异生的原料 369 (p2-9-1-2): 二、糖异生的反应 372 (p2-9-1-3): 三、其他物质进入糖异生 373 (p2-9-1-4): 四、糖异生的能量消耗 373 (p2-9-2): 第二节 糖异生的生理功能 373 (p2-9-2-1): 框25-1 生化研究动态——嗜热古菌的一种特殊的双功能酶 374 (p2-9-3): 第三节 糖异生的调节 378 (p2-10): 第二十六章 光合作用 378 (p2-10-1): 第一节 光合作用的基本过程 378 (p2-10-2): 第二节 植物光合作用的细胞器——叶绿体 378 (p2-10-3): 第三节 光反应 378 (p2-10-3-1): 一、光能的吸收和传递 378 (p2-10-3-2): 二、产氧光合有机体的光系统 378 (p2-10-3-3): 三、PSII内发生的光化学反应 378 (p2-10-3-4): 四、电子从PSII经细胞色素b6/f复合体到PSI的传递 378 (p2-10-3-5): 五、PSI内发生的光化学反应 378 (p2-10-3-6): 六、NADP+的还原 378 (p2-10-3-7): 七、光合磷酸化 378 (p2-10-3-8): 框26-1生化奇迹——最简单的光能转换装置 378 (p2-10-3-9): 八、光反应的调节 378 (p2-10-3-10): 框26-2生化新发现——分子变光开关 378 (p2-10-4): 第四节 暗反应 378 (p2-10-4-1): 一、C3循环与C3植物 378 (p2-10-4-2): 二、光呼吸 378 (p2-10-4-3): 三、C4植物降低光呼吸的机制 378 (p2-10-4-4): 四、CAM植物降低光呼吸的机制 378 (p2-10-5): 第五节 卡尔文循环的调节 378 (p2-10-5-1): 科学故事——卡尔文循环的发现 378 (p2-11): 第二十七章 糖原代谢 378 (p2-11-1): 第一节 糖原的分解 378 (p2-11-1-1): 一、细胞质基质内糖原的分解 380 (p2-11-1-2): 二、溶酶体内糖原的分解 380 (p2-11-1-3): 框27-1生化研究动态——神经元如何动用星形胶质细胞中的糖原贮备 381 (p2-11-2): 第二节 糖原的合成 383 (p2-11-2-1): 框27-2生化点滴——三大能源贮备比较 384 (p2-11-3): 第三节 糖原代谢的调节 384 (p2-11-3-1): 一、别构调节 385 (p2-11-3-2): 二、受激素控制的“可逆磷酸化”调节 388 (p2-11-3-3): 框27-3生化与健康——糖原累积病的病因、症状和治疗 389 (p2-11-3-4): 科学故事——糖原素的发现 391 (p2-12): 第二十八章 脂肪、磷脂和糖脂的代谢 391 (p2-12-1): 第一节 脂肪代谢 391 (p2-12-1-1): 一、脂肪的水解 392 (p2-12-1-2): 二、脂肪的合成 393 (p2-12-1-3): 框28-1 生化与健康——TZD治疗II型糖尿病的机制 394 (p2-12-2): 第二节 磷脂代谢 394 (p2-12-2-1): 一、磷脂的分解 394 (p2-12-2-2): 二、磷脂的合成 397 (p2-12-3): 第三节 糖脂代谢 397 (p2-12-3-1): 一、糖脂的分解 397 (p2-12-3-2): 二、糖脂的合成 398 (p2-12-3-3): 科学故事——瘦蛋白及其受体的发现 400 (p2-13): 第二十九章 脂肪酸代谢 400 (p2-13-1): 第一节 脂肪酸的分解 400 (p2-13-1-1): 一、脂肪酸的β-氧化 405 (p2-13-1-2): 二、脂肪酸的a-氧化和ω-氧化 406 (p2-13-1-3): 三、酮体的生成和利用 408 (p2-13-1-4): 框29-1生化小故事——让魏茨曼生物发酵产生丙酮 409 (p2-13-2): 第二节 脂肪酸的合成 409 (p2-13-2-1): 一、脂肪酸合成的一般性质 409 (p2-13-2-2): 二、脂肪酸合成的详细机制 414 (p2-13-3): 第三节 脂肪酸代谢的调控 414 (p2-13-3-1): 一、脂肪酸分解代谢的调控 414 (p2-13-3-2): 二、脂肪酸合成代谢的调控 416 (p2-13-3-3): 框29-2生化与健康——减肥的新希望 417 (p2-14): 第三十章 胆固醇代谢 417 (p2-14-1): 第一节 胆固醇的合成 420 (p2-14-1-1): 框30-1生化医药——降胆固醇药物的新靶点 421 (p2-14-2): 第二节 胆固醇的转运 422 (p2-14-2-1): 一、乳糜微粒 422 (p2-14-2-2): 二、极低密度脂蛋白 423 (p2-14-2-3): 三、中间密度脂蛋白 423 (p2-14-2-4): 四、低密度脂蛋白 424 (p2-14-2-5): 五、高密度脂蛋白 425 (p2-14-2-6): 框30-2生化与健康——食物中的胆固醇究竟该不该限制? 426 (p2-14-3): 第三节 胆固醇的代谢转变 427 (p2-14-4): 第四节 胆固醇代谢的调节 427 (p2-14-4-1): 一、HMG-CoA还原酶的可逆磷酸化 427 (p2-14-4-2): 二、HMG-CoA还原酶的降解 428 (p2-14-4-3): 三、HMG-CoA还原酶基因表达的调控 429 (p2-14-4-4): 科学故事——LDL受体的发现 430 (p2-15): 第三十一章 氨基酸代谢 430 (p2-15-1): 第一节 氨基酸的分解 430 (p2-15-1-1): 一、氨基的代谢 432 (p2-15-1-2): 二、氨的进一步代谢转变 435 (p2-15-1-3): 框31-1尿素的新功能——保护冬眠的青蛙免受冻伤 439 (p2-15-1-4): 框31-2理论联系实际——“冬眠”的生化 440 (p2-15-1-5): 三、碳骨架的代谢 441 (p2-15-2): 第二节 氨基酸及其衍生物的合成 441 (p2-15-2-1): 科学故事——科学家发现海洋中微小硅藻也有尿素循环 443 (p2-16): 第三十二章 核苷酸代谢 443 (p2-16-1): 第一节 核苷酸的合成 443 (p2-16-1-1): 一、核苷酸的从头合成 448 (p2-16-1-2): 二、核苷酸的补救合成 449 (p2-16-1-3): 三、NDP和NTP的合成 449 (p2-16-1-4): 四、脱氧核苷酸的合成 451 (p2-16-1-5): 五、dTMP的合成 452 (p2-16-1-6): 六、核苷酸类辅酶的合成 452 (p2-16-1-7): 框32-1生化聚焦——噬菌体对宿主菌内核苷酸代谢途径的改造 452 (p2-16-2): 第二节 核苷酸合成的调节 452 (p2-16-2-1): 一、嘌呤核苷酸合成的调节 453 (p2-16-2-2): 二、嘧啶核苷酸合成的调节 453 (p2-16-2-3): 三、脱氧核苷酸合成的调节 454 (p2-16-3): 第三节 核苷酸的分解 454 (p2-16-3-1): 一、嘌呤核苷酸的分解 456 (p2-16-3-2): 二、嘧啶核苷酸的分解 456 (p2-16-4): 第四节 几种与核苷酸代谢相关的疾病 456 (p2-16-4-1): 一、痛风 457 (p2-16-4-2): 二、严重联合免疫缺陷病 458 (p2-16-4-3): 三、Lesch-Nyhan综合征 458 (p2-16-4-4): 四、乳清酸尿症 458 (p2-16-5): 第五节 常见的抗核苷酸代谢药物 458 (p2-16-5-1): 一、叶酸类似物 458 (p2-16-5-2): 二、谷氨酰胺类似物 459 (p2-16-5-3): 三、碱基类似物 459 (p2-16-5-4): 四、核苷类似物 460 (p2-16-5-5): 五、核苷酸类似物 460 (p2-16-5-6): 科学故事——灵长类动物在进化过程中为什么失去了尿酸氧化酶? 463 (p3): 第三篇 分子生物学 464 (p3-1): 分子生物学内容简介及学习方法 466 (p3-2): 第三十三章 DNA复制 466 (p3-2-1): 第一节 DNA复制的一般特征 468 (p3-2-1-1): 框33-1 生化新突破——DNA生物合成一定需要引物吗? 470 (p3-2-2): 第二节 参与DNA复制的主要酶和蛋白质 470 (p3-2-2-1): 一、DNA聚合酶 475 (p3-2-2-2): 二、DNA解链酶 475 (p3-2-2-3): 三、单链DNA结合蛋白(SSB) 476 (p3-2-2-4): 四、DNA拓扑异构酶 477 (p3-2-2-5): 五、DNA引发酶 477 (p3-2-2-6): 六、切除引物的酶 477 (p3-2-2-7): 七、DNA连接酶 477 (p3-2-2-8): 八、端粒酶 479 (p3-2-2-9): 框33-2生化与健康——端粒激活与青春再现 480 (p3-2-3): 第三节 DNA复制的详细机制 480 (p3-2-3-1): 一、 以大肠杆菌为代表的细菌基因组DNA的“0复制”系统 485 (p3-2-3-2): 二、滚环复制系统 486 (p3-2-3-3): 三、D环复制系统 487 (p3-2-3-4): 四、真核细胞的DNA复制 490 (p3-2-3-5): 五、古菌的DNA复制 491 (p3-2-3-6): 框33-3 DNA复制也有节律 492 (p3-2-4): 第四节 DNA复制的高度忠实性 492 (p3-2-5): 第五节 DNA复制的调节机制 492 (p3-2-5-1): 一、细菌DNA复制起始的调控 493 (p3-2-5-2): 二、真核细胞DNA复制起始的调控 493 (p3-2-5-3): 框33-4生化研究动态——干细胞分裂过程中的染色体分离 494 (p3-2-5-4): 科学故事——DNA半保留复制的实验证明 497 (p3-3): 第三十四章 DNA的损伤、修复和突变 497 (p3-3-1): 第一节 DNA的损伤 498 (p3-3-2): 第二节 DNA的修复 498 (p3-3-2-1): 一、直接修复 500 (p3-3-2-2): 框34-1 身边的生物化学——追星的代价 501 (p3-3-2-3): 二、切除修复 506 (p3-3-2-4): 三、双链断裂修复 507 (p3-3-2-5): 四、损伤跨越 510 (p3-3-3): 第三节 DNA的突变 510 (p3-3-3-1): 一、突变的类型与后果 511 (p3-3-3-2): 二、突变的原因 514 (p3-3-3-3): 三、回复突变与突变的校正 515 (p3-3-3-4): 四、突变原与致癌物质之间的关系以及致癌物质的检测 516 (p3-3-3-5): 科学故事——TTDA的发现 517 (p3-4): 第三十五章 DNA重组 517 (p3-4-1): 第一节 同源重组 517 (p3-4-1-1): 一、同源重组的模型 520 (p3-4-1-2): 二、参与同源重组的主要酶和蛋白质 522 (p3-4-1-3): 三、细菌的同源重组 522 (p3-4-1-4): 四、古菌的同源重组 522 (p3-4-2): 第二节 位点特异性重组 523 (p3-4-2-1): 一、λ噬菌体DNA的位点特异性整合 525 (p3-4-2-2): 二、鼠伤寒沙门氏菌鞭毛抗原的转换 526 (p3-4-3): 第三节 转座重组 526 (p3-4-3-1): 一、细菌的转座 527 (p3-4-3-2): 二、真核生物的转座 530 (p3-4-3-3): 三、古菌的转座子 531 (p3-4-3-4): 框35-1生化趣事——谁偷走了人的DNA? 531 (p3-4-3-5): 四、转座的分子机制 531 (p3-4-3-6): 五、转座作用的调节 533 (p3-4-3-7): 框35-2生化突破——睡美人转座子的复活 534 (p3-4-3-8): 科学故事——“跳跃基因”的发现 536 (p3-5): 第三十六章 DNA转录 536 (p3-5-1): 第一节 DNA转录的一般特征 537 (p3-5-2): 第二节 依赖DNA的RNA聚合酶 538 (p3-5-2-1): 一、细菌的RNA聚合酶 539 (p3-5-2-2): 二、真核生物的RNA聚合酶 541 (p3-5-2-3): 框36-1身边的生物化学——路边的“野蘑菇”你不要采 541 (p3-5-2-4): 三、古菌的RNA聚合酶 542 (p3-5-2-5): 四、某些病毒的RNA聚合酶 542 (p3-5-3): 第三节 细菌的DNA转录 542 (p3-5-3-1): 一、转录的起始 545 (p3-5-3-2): 二、转录的延伸 546 (p3-5-3-3): 三、转录的终止 548 (p3-5-4): 第四节 真核生物核基因的转录 548 (p3-5-4-1): 一、真核细胞核转录系统与细菌转录系统的异同 549 (p3-5-4-2): 二、真核细胞核DNA的转录 557 (p3-5-4-3): 三、真核细胞细胞器DNA的转录 558 (p3-5-5): 第五节 古菌的DNA转录 559 (p3-5-5-1): 框36-2生化研究动态——当转录遇到DNA损伤 560 (p3-5-5-2): 科学故事——mRNA的发现 563 (p3-6): 第三十七章 转录后加工 563 (p3-6-1): 第一节 细菌的转录后加工 563 (p3-6-1-1): 一、mRNA前体的后加工 563 (p3-6-1-2): 二、rRNA前体的后加工 564 (p3-6-1-3): 三、tRNA前体的后加工 565 (p3-6-2): 第二节 真核生物的转录后加工 565 (p3-6-2-1): 一、mRNA前体的后加工 575 (p3-6-2-2): 框37-1生化研究动态——U1 snRNP的新功能 579 (p3-6-2-3): 框37-2生化聚焦——章鱼抗寒的秘密 579 (p3-6-2-4): 二、rRNA前体的后加工 581 (p3-6-2-5): 三、tRNA前体的后加工 582 (p3-6-3): 第三节 古菌的转录后加工 583 (p3-6-3-1): 科学故事——第一例真正核酶的发现 585 (p3-7): 第三十八章 基因组RNA的复制 585 (p3-7-1): 第一节 依赖于RNA的RNA合成 585 (p3-7-1-1): 一、双链RNA病毒的RNA复制 586 (p3-7-1-2): 二、单链RNA病毒的RNA复制 586 (p3-7-2): 第二节 以DNA为中间物的RNA复制 586 (p3-7-2-1): 一、反转录病毒的RNA复制 589 (p3-7-2-2): 框38-1身边的生物化学——有天生不会感染HIV的人吗? 592 (p3-7-2-3): 二、反转录转座子 592 (p3-7-2-4): 三、端粒酶催化的反转录反应 592 (p3-7-2-5): 四、某些DNA病毒生活史中的反转录现象 593 (p3-7-2-6): 科学故事——反转录酶的发现 595 (p3-8): 第三十九章 mRNA的翻译 595 (p3-8-1): 第一节 参与翻译的主要生物大分子以及复合物 595 (p3-8-1-1): 一、核糖体 597 (p3-8-1-2): 二、mRNA 597 (p3-8-1-3): 三、tRNA 598 (p3-8-1-4): 四、氨酰tRNA合成酶 600 (p3-8-1-5): 五、辅助蛋白因子 601 (p3-8-2): 第二节 翻译的一般特征 603 (p3-8-3): 第三节 翻译的详细机制 604 (p3-8-3-1): 框39-1生化新突破——催化氨酰tRNA合成的最小核酶的问世 604 (p3-8-3-2): 一、细菌的翻译系统 610 (p3-8-3-3): 二、真核生物的细胞质翻译系统 615 (p3-8-3-4): 三、细胞器翻译系统 615 (p3-8-3-5): 四、古菌的翻译系统 616 (p3-8-4): 第四节 翻译的质量控制 616 (p3-8-4-1): 一、细菌的翻译质量控制 618 (p3-8-4-2): 二、真核生物的翻译质量控制 620 (p3-8-4-3): 三、古菌的翻译质量控制 620 (p3-8-5): 第五节 翻译的抑制剂 620 (p3-8-5-1): 一、细菌翻译系统的抑制剂 621 (p3-8-5-2): 二、真核翻译系统的抑制剂 621 (p3-8-5-3): 三、既抑制细菌又抑制古菌和真核翻译系统的抑制剂 622 (p3-8-5-4): 框39-2身边的生物化学——为什么蓖麻毒素不会杀死蓖麻自身? 622 (p3-8-6): 第六节 蛋白质在细胞内的降解 622 (p3-8-6-1): 一、细胞内不依赖于ATP的蛋白质降解系统 623 (p3-8-6-2): 二、细胞内依赖于ATP的蛋白质降解系统 626 (p3-8-6-3): 科学故事——“N端规则”的发现 628 (p3-9): 第四十章 蛋白质的翻译后加工及其定向和分拣 628 (p3-9-1): 第一节 翻译后加工 628 (p3-9-1-1): 一、多肽链的剪切 628 (p3-9-1-2): 二、N端添加氨基酸 628 (p3-9-1-3): 三、蛋白质的剪接 629 (p3-9-1-4): 框40-1生化探寻——内含肽的“内涵” 629 (p3-9-1-5): 四、个别氨基酸的修饰 632 (p3-9-1-6): 五、添加辅因子 632 (p3-9-1-7): 六、寡聚蛋白质的寡聚化 633 (p3-9-1-8): 七、蛋白质的折叠 633 (p3-9-2): 第二节 蛋白质翻译后的定向转运与分拣 633 (p3-9-2-1): 一、信号假说 634 (p3-9-2-2): 二、蛋白质的共翻译定向 637 (p3-9-2-3): 三、蛋白质的翻译后定向 642 (p3-9-2-4): 科学故事——“信号假说”的提出和证明 645 (p3-10): 第四十一章 再次程序化的遗传解码和翻译暂停 645 (p3-10-1): 第一节 再次程序化的遗传解码 645 (p3-10-1-1): 一、翻译水平的移框 645 (p3-10-1-2): 二、通读 645 (p3-10-1-3): 三、跳跃翻译 645 (p3-10-1-4): 四、硒代半胱氨酸和吡咯赖氨酸的参入 645 (p3-10-1-5): 框41-1生化点滴——含硒蛋白知多少 645 (p3-10-2): 第二节 翻译暂停 645 (p3-11): 第四十二章 原核生物的基因表达调控 645 (p3-11-1): 第一节 正调控与负调控 646 (p3-11-2): 第二节 在DNA水平上的调控 647 (p3-11-3): 第三节 在转录水平上的调控 647 (p3-11-3-1): 一、转录起始阶段的调控 656 (p3-11-3-2): 二、转录终止阶段的调控——终止与抗终止 659 (p3-11-3-3): 框42-1生化小故事——“核开关”的发现 660 (p3-11-3-4): 框41-2生化研究动态——探测氟离子的核开关 661 (p3-11-4): 第四节 在翻译水平上的调控 661 (p3-11-4-1): 一、反义RNA 661 (p3-11-4-2): 二、核开关 663 (p3-11-4-3): 三、自体调控 664 (p3-11-4-4): 四、mRNA的降解 665 (p3-11-4-5): 五、mRNA的二级结构与基因表达的调控 665 (p3-11-5): 第五节 环境信号诱发的基因表达调控 665 (p3-11-5-1): 一、严紧反应 666 (p3-11-5-2): 二、CRISPR-Cas系统 668 (p3-11-5-3): 三、二元基因表达调控系统 669 (p3-11-5-4): 四、群体感应 670 (p3-11-5-5): 框42-3生化趣事——病毒之间也可以通过化学语言进行交流 671 (p3-11-6): 第六节 在基因组水平上的全局调控 671 (p3-11-6-1): 一、调节子 672 (p3-11-6-2): 二、噬菌体基因表达的时序控制 672 (p3-11-6-3): 科学故事——CRISPR-Cas9系统的“前身今世” 676 (p3-12): 第四十三章 真核生物的基因表达调控 676 (p3-12-1): 第一节 在染色质水平上的基因表达调控 677 (p3-12-1-1): 一、组蛋白的化学修饰对基因表达的影响 679 (p3-12-1-2): 二、染色质重塑因子对基因表达的影响 681 (p3-12-1-3): 三、组蛋白变体对基因表达的影响 682 (p3-12-1-4): 四、lncRNA对基因表达的影响 683 (p3-12-2): 第二节 在DNA水平上的基因表达调控 683 (p3-12-2-1): 一、DNA扩增 683 (p3-12-2-2): 二、DNA重排 687 (p3-12-2-3): 三、基因丢失 687 (p3-12-2-4): 四、DNA甲基化 689 (p3-12-2-5): 框43-1 身边的生物化学——蜂王称王的秘密 690 (p3-12-2-6): 框43-2生化趣事——运动和咖啡因也会改变你的DNA 690 (p3-12-2-7): 五、DNA印记 691 (p3-12-2-8): 六、多个启动子的选择性使用 691 (p3-12-3): 第三节 在转录水平上的基因表达调控 692 (p3-12-3-1): 一、顺式作用元件 694 (p3-12-3-2): 二、转录因子 698 (p3-12-3-3): 三、参与转录水平调节的lncRNA 699 (p3-12-3-4): 四、转录水平调控的实例 702 (p3-12-4): 第四节 在转录后加工水平上的基因表达调控 702 (p3-12-4-1): 一、选择性剪接 703 (p3-12-4-2): 二、选择性加尾 704 (p3-12-4-3): 三、组织特异性RNA编辑 704 (p3-12-4-4): 四、lncRNA在转录后加工水平的调节 704 (p3-12-4-5): 五、在mRNA运输水平上的调控 705 (p3-12-5): 第五节 在翻译及翻译后加工水平上的调控 705 (p3-12-5-1): 一、自体调控 705 (p3-12-5-2): 二、mRNA定位 706 (p3-12-5-3): 三、mRNA的“屏蔽” 707 (p3-12-5-4): 框43-3生化小故事——RNAi的发现 708 (p3-12-5-5): 四、RNA干扰 713 (p3-12-5-6): 五、mRNA的降解和稳定性与基因表达调控 714 (p3-12-5-7): 六、对翻译过程本身的调节 715 (p3-12-5-8): 七、lncRNA在翻译水平的调节 716 (p3-12-5-9): 八、翻译后水平的调节 716 (p3-12-5-10): 科学故事——果蝇昼夜节律分子机制的发现